التعاون الياباني في مصر مستمر منذ فترة طويلة، وقد نفذت اليابان ولا زالت تعمل على تنفيذ العديد من المشروعات من أجل التنمية الاقتصادية والتنمية الاجتماعية في مصر، مثل مشروع الجامعة المصرية اليابانية للعلوم والتكنولوجيا E-JUST .
تقع هذه الجامعة في مدينة برج العرب (بالقرب من الإسكندرية) وهي جامعة بحثية للدراسات العليا تأخذ بالتعليم الهندسي في اليابان. إلى جانب الأجهزة التي قدمتها اليابان، تقوم 12 من الجامعات الرائدة في اليابان بتقديم الدعم للجامعة.